Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GNPDA1P46926 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNPDA1P46926 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms