Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
BRCC3P46736 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCC3P46736 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCC3P46736 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCC3P46736 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCC3P46736 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRCC3P46736 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms