Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFMP43652 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFMP43652 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFMP43652 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFMP43652 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFMP43652 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFMP43652 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFMP43652 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms