Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIK3CAP42336 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms