Protein–RNA interactions for Protein: P38711

RPS27B, 40S ribosomal protein S27-B, yeastyeast

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS27BP38711 YCR015CYCR015C 954 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YDR286CYDR286C 345 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 MRP49YKL167C 414 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 ABF2YMR072W 552 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 LSM7YNL147W 348 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 SRL4YPL033C 846 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 CTK1YKL139W 1587 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 SWI4YER111C 3282 nt0.09□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 CLG1YGL215W 1359 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 AIM9YER080W 1884 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 PAN2YGL094C 3348 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 SPC2YML055W 537 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YOR376WYOR376W 369 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 CCL1YPR025C 1182 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 APC5YOR249C 2058 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 UTP8YGR128C 2142 nt0.08□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 FMN1YDR236C 657 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YFR054CYFR054C 579 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YFR056CYFR056C 369 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YGL118CYGL118C 438 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 TAD1YGL243W 1203 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YHR145CYHR145C 357 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 REX3YLR107W 1215 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.07□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 RTR1YER139C 681 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YKL177WYKL177W 339 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YLR169WYLR169W 354 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YBL029WYBL029W 1131 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 SWS2YNL081C 432 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 snR13snR13 124 nt0.06□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 THO2YNL139C 4794 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 STE5YDR103W 2754 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 BRO1YPL084W 2535 nt0.05□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 ECM12YHR021W-A 456 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YIL012WYIL012W 342 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YIR020CYIR020C 303 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 IRC14YOR135C 342 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 LDH1YBR204C 1128 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 PKH2YOL100W 3246 nt0.04□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 DSE2YHR143W 978 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YNL226WYNL226W 411 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 ADF1YCL058W-A 342 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 YSP1YHR155W 3687 nt0.03□□□□□ -2.4
RPS27BP38711 NGG1YDR176W 2109 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 DIG2YDR480W 972 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YGL138CYGL138C 1038 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 ABM1YJR108W 372 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 RPL37AYLR185W 267 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 RPL6BYLR448W 531 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 snR45snR45 172 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 ZRG8YER033C 3231 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YLL054CYLL054C 2532 nt0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 CDC10YCR002C 969 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 PRM8YGL053W 714 nt0.01□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 FAR7YFR008W 666 nt0□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 EMC5YIL027C 426 nt0□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YIL141WYIL141W 390 nt0□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 JJJ2YJL162C 1752 nt0□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 GDS1YOR355W 1569 nt0□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 AFR1YDR085C 1863 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 SNA4YDL123W 423 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YDL157CYDL157C 357 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YPL034WYPL034W 498 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 MUB1YMR100W 1863 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 BEM3YPL115C 3387 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 RIM20YOR275C 1986 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 CYC7YEL039C 342 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 MAM1YER106W 909 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 SDL1YIL167W 633 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 MXR1YER042W 555 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YGR064WYGR064W 369 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 SRP21YKL122C 504 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YMR324CYMR324C 243 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 RPB5YBR154C 648 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 ICS2YBR157C 768 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPS27BP38711 CDC5YMR001C 2118 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 CDC27YBL084C 2277 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 DUO1YGL061C 744 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 YGL109WYGL109W 324 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 SAY1YGR263C 1275 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 YHR022CYHR022C 771 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 BMT5YIL096C 1011 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 POP8YBL018C 402 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 TYE7YOR344C 876 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 LOA1YPR139C 903 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 PRP39YML046W 1890 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 AHC2YCR082W 387 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 RRG1YDR065W 1098 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 RCN1YKL159C 636 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 YLR225CYLR225C 1224 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 YBL077WYBL077W 432 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 DAS1YJL149W 1992 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPS27BP38711 MSC6YOR354C 2079 nt-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 167.8 ms