Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPAP38571 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPAP38571 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPAP38571 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
LIPAP38571 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPAP38571 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms