Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7BP35670 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7BP35670 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms