Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDIT3P35638 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDIT3P35638 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms