Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPB2P35606 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPB2P35606 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPB2P35606 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPB2P35606 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB2P35606 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB2P35606 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB2P35606 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms