Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms