Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P33897 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms