Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTX2P32243 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms