Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA10P31260 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.8 ms