Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRBP28702 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRBP28702 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRBP28702 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRBP28702 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRBP28702 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRBP28702 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRBP28702 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRBP28702 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRBP28702 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRBP28702 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRBP28702 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRBP28702 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRBP28702 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRBP28702 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRBP28702 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRBP28702 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RXRBP28702 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRBP28702 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRBP28702 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRBP28702 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRBP28702 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRBP28702 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRBP28702 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRBP28702 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRBP28702 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRBP28702 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RXRBP28702 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRBP28702 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms