Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARK3P27448 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARK3P27448 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARK3P27448 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARK3P27448 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARK3P27448 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARK3P27448 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARK3P27448 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARK3P27448 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms