Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CNTFRP26992 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms