Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSSP25774 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSSP25774 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTSSP25774 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSSP25774 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSSP25774 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms