Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTAFRP25105 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms