Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK2P24941 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK2P24941 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK2P24941 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK2P24941 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK2P24941 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK2P24941 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK2P24941 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms