Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP100P23497 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP100P23497 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP100P23497 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP100P23497 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP100P23497 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP100P23497 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP100P23497 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP100P23497 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP100P23497 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP100P23497 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP100P23497 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP100P23497 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP100P23497 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms