Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNA2P20248 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms