Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHCEP18577 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHCEP18577 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHCEP18577 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHCEP18577 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHCEP18577 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHCEP18577 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHCEP18577 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHCEP18577 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHCEP18577 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHCEP18577 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHCEP18577 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHCEP18577 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHCEP18577 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHCEP18577 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHCEP18577 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHCEP18577 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHCEP18577 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms