Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCP1P17987 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCP1P17987 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCP1P17987 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCP1P17987 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCP1P17987 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCP1P17987 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCP1P17987 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCP1P17987 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCP1P17987 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCP1P17987 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms