Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTPS1P17812 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms