Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7P17544 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF7P17544 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF7P17544 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms