Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCFC2P16383 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms