Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA1P15085 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA1P15085 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA1P15085 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA1P15085 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA1P15085 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA1P15085 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA1P15085 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA1P15085 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms