Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms