Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XRCC5P13010 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC5P13010 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms