Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD28P10747 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD28P10747 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD28P10747 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms