Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms