Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms