Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms