Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFMP07197 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFMP07197 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFMP07197 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFMP07197 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFMP07197 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFMP07197 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFMP07197 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFMP07197 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEFMP07197 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEFMP07197 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEFMP07197 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEFMP07197 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEFMP07197 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEFMP07197 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEFMP07197 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEFMP07197 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms