Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3P05106 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3P05106 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms