Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL10P02778 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL10P02778 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms