Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UFL1O94874 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UFL1O94874 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UFL1O94874 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UFL1O94874 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UFL1O94874 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UFL1O94874 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UFL1O94874 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UFL1O94874 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms