Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FLOT1O75955 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms