Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3O75154 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3O75154 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms