Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms