Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR3O43761 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms