Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms