Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREHO43280 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREHO43280 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREHO43280 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TREHO43280 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREHO43280 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREHO43280 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms