Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DYNC1LI2O43237 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DYNC1LI2O43237 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms