Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGSM2O43147 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM2O43147 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms