Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEFVO15553 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEFVO15553 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEFVO15553 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEFVO15553 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEFVO15553 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms