Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM6AO15550 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms