Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ2O15056 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SYNJ2O15056 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms