Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IKBKBO14920 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms