Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APAF1O14727 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APAF1O14727 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
APAF1O14727 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
APAF1O14727 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APAF1O14727 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APAF1O14727 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APAF1O14727 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APAF1O14727 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APAF1O14727 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APAF1O14727 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APAF1O14727 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APAF1O14727 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms